俄罗斯边防警备厅海上巡逻艇“误杀”日本到争议海区非法捕捞海产品的两名日本渔民，且扣押了其余的四名日本渔民和渔船的消息很快就在日本国内传扬了开来。不出方明远所料，立时在日本国内引起了喧然大波，媒体密集报道，大量日本国民游行要求政府搭救被扣留在俄罗斯的日本渔民，接回遇难渔民遗体，并要求俄罗斯政府就此事赔礼道歉惩办凶手！
为了应对这一意外事件，日本政府已经在首相官邸的危机管理中心设立了应对这一事件的信息联络室，海上保安部目前也已派出巡逻艇等前往事发海域收集相关情报。
日本首相再次召见俄罗斯驻日本大使米哈伊尔.克鲁斯基，就此事向俄罗斯政府发出了强烈抗议。与此同时，日本驻俄罗斯大使也前往克里姆林宫求见俄罗斯总统，并当面递交了日本政府的抗议书。
但是，无论是俄罗斯驻日本大使米哈伊尔.克鲁斯基，还是俄罗斯总统，在这件事情上的态度都是十分明确和强硬的。米哈伊尔.克鲁斯基接受日本媒体采访时表示，日本渔船被扣留的地点位于俄罗斯领海内，日本渔船是非法进入了俄罗斯海域。俄罗斯边防警备厅的巡逻艇发现后要求他们立即停止航行，但是日本渔船根本无视俄罗斯方面的一再警告，一边向海中倾倒海产品，一边加速想要驶离，俄罗斯方面只能向空中开枪警告，迫使其停船。
至于两名日本渔民被枪杀一事，米哈伊尔.克鲁斯基则表示，俄罗斯方面也并不希望发生这种事情，对遇难日本渔民表示哀悼。但是，俄罗斯边防警备厅的巡逻艇是在实施法律权限内的行为，日本渔船当时一再不听从俄罗斯方面的停船命令而逃跑。采取了“危险行动”，迫使俄罗斯执法人员不得不对空开枪示警，他们也不明白为什么会有日本渔民被“流弹”击中。俄罗斯方面正在调查此事，如果说真的是因为俄罗斯执法人员开枪的缘故，考虑到当时海上浪高风急，那也只是一个令人遗憾的意外事件！他再次提醒日本渔民，不要到俄罗斯海域进行非法捕捞，而且当俄罗斯边防警备厅的巡逻艇要求他们停船接受检查的时候，不要抱可以逃脱的妄想！
日本渔业厅的官员则表示，就目前国际状况来看。日本渔船确实是不应当去北方四岛海域进行捕捞，而日本外务省官