全舰分为28个主水密隔舱段从第3第24舱段为主装甲堡区域舰体主全部装甲防护保护了98％的水线长度%c的浮力以及储备浮力空间这是任何同时期战舰也无法做到的大手笔。
在巨大的舰体主装甲堡内德国人又在纵向和横向上安装了多重装甲和水密隔板。以锅炉舱段下部舰体为例除了两舷各拥有宽度为5.5米的防雷隔离舱外内部又被分成三个并排布置的水密隔舱每个隔舱内安放着两台高压重油锅炉。”威廉三世”号拥有两个这样的舱段它们中间被一个副炮弹药库舱段隔开。在这样的布置下一个锅炉舱进水战舰只会损失六分之一的动力来自一个舷侧方向的攻击最多只能让战舰的两个锅炉舱进水损失三分之一的动力。
此外与其它国家的战列舰不同依托大量的横向、纵向和水平装甲该舰在主水平装甲以上的上部舰体内也设置了大量的水密隔舱。加上下部舰体”威廉三世”号全舰被细分成数千个大小不一的独立水密隔舱就像锅炉一样该舰每个重要的子系统都被以尽可能降低风险的原理分隔放置在这些隔舱内从实战情况来看英国人很难用单一的常规攻击方式毁灭该级战舰。！