根据刚刚制定的艾梅拉宪法草案，任何贵族和政府机构文官，均无权对epla部队下达命令。如果有紧急事务需要调动军队，必须立即向艾梅拉中央政府上报申请。
epla部队只服从上级军事主官的领导，文官和贵族无权干预军队的任何事务，如果有军人触犯法律，则应交由军事法庭审理。这一条款，同样适用于地方教会——军队的所有宗教事务均由军队自己内部的宗教委员处理。
换句话说，在整个艾梅拉，只有一名文官能够指挥军队——那就是艾梅拉国家元首——而且必须以艾梅拉三军总司令或者最大主教的名义下达命令。当然，在非军事管制状态下，如果没有三军总司令的命令，军队同样无权干预任何地方事务。
epla的最高指挥机关，为艾梅拉最高军事委员会——该委员会主席由国家元首兼任。委员会下设总部机关，总参谋部、总装备部、总政治部和总后勤部四个部门，称为epla“四总部”。
它们既是最高军委的工作机关，又是掌管epla全军军事、政治、宗教、后勤、装备工作的领导机关。其基本任务是：保障**关于作战和建军的战略决策和各项方针、政策的实现。
其中，总装备部负责全军武器装备研发规划；总政治部负责全军政治与宗教事务；总后勤部负责全军后勤保障统一规划。而总参谋部，则是总部机关的主要领导部门——它负责组织领导全国武装力量的军事建设，组织指挥全国武装力量的军事行动的军事领导机关，设有作战、情报、通信、军训、军务、动员、装备、机要、测绘、外事、管理以及各兵种业务部门。
总参谋部的最高领导为三军总参谋长，兼任epla三军副总司令和最高军委第一副主席，和平时期负责部队的全部常务工作，战争时期负责指挥epla全军。当然，总参谋长想要调动和指挥部队，必须要得到最高领导人的许可——一般情况下，在对作战计划没有异议的情况下，战争时期国家元首会直接给总参谋长必要的授权，以便于其指挥作战。
现在被epla承认的艾梅拉国家元首是艾尔·w·亚莉亚，而三军总参谋长自然就是蒋玉成了。
原有的艾梅拉共和军艾尔·w·亚莉亚警卫旗队，则被改编成了艾梅拉