明秋在完成对厦门和鼓浪屿的占领之后，命令将前指移到厦门岛上――虽然治安战还没有完全结束，不过岛上已经没有郑家的堡寨和成规模的人马了。只有一部分散兵游勇躲藏在山林里。石志奇发动起治安军去执行搜索任务，每一队治安军再配几个俘虏，许诺每抓到一个他们从前的袍泽就赏给一块银元，于是俘虏们一个个劲头十足的带着治安军翻山越岭的抓人。这样一来，厦门岛、鼓浪屿和金门岛上的治安战行动很快就取得了大的进展。
现在他的任务已经完成了三分之二，剩下的主要是防敌反扑，掩护安平、厦门、金门各处的民事肃清工作－－正式文件中对大规模的搜刮和抓捕的委婉说法。
整个民事肃清计划要一到二周时间才能结束，在此之前，他要确保这些占领区在元老院手中，以便企划院和情报局能够从容的执行任务。
安平方向是最有可能发生反扑的地点，郑家在南安和晋江都有大片土地和庄园，私兵和乡勇人数众多，相对于友军有难不动如山的大明官军来说，这些人马只要有人指挥加上足够的银子，还是能爆发出可观的战斗力的。为此明秋将防御重点放在安平方向。后续部队的主力陆军部队布置在安平附近，随时监视着两县的动静。
对安平等地的突袭击毙和俘虏了一大批郑氏集团的上层和骨干分子。不过总有一些漏网之鱼，特别是在金门和厦门。有些见机的快的人，趁着海军还没来得及封锁就渡过海峡逃到大陆上去了。
到底有几个“十八芝”的成员逃出生天目前还没有确切的答案。根据初步的审俘得知：郑芝凤、郑芝豹和郑联、郑彩等十八芝中的首要人物脱逃了好些个。这几个人都在郑氏集团里有较大的威望和实力，完全可能组织起成规模的反击。
至于郑氏集团的首脑人物郑芝龙。已经由黄蜂队报告“疑似”击毙。尽管没有过硬的证据，不过情报局根据钱水协当时拍下的照片和提取到的证物分析，这具无头尸体极有可能就是郑芝龙本人。而他们在厦门岛上俘虏的多名日本人和黑人卫队俘虏的供词都证明了郑芝龙的逃跑路线，只是两股偷越封锁线的人员已经被全歼，没有人可以提供有力的口供证据。为此明秋已经派人去挖掘尸体，并且发电到高雄，请有关方面的专业人士来验尸。