自从THEONE被奈克斯特消灭之后，没有人知道他们去了哪里，更没有人知道还不会不会再次见到那个拯救了他们的银色光之巨人。
被毁灭的新宿也在建设之中，人类似乎再次回到了那个整天上班的日子。
数个月之后，发生了第一起失踪案件，所有人都没当做一回事，直到第二起，第三起，甚至第四起同样的案件出现，所有人才开始关注了起来。
那时，整个世界都出现了这个情况，个个国家都有这种事件的发生。
经过国家政府的调查之后发现是THEONE留下的遗产，化成的异生兽分子与世界各地的生物结合成为了新的异生兽。
此时想要阻止，已“二五七”经来不及了，全世界都知道了这种生物，无数的人类纷纷恐惧着这种生物，导致异生兽的疯狂进化，泛滥成灾。
最终，来访者和北米联合部做出了一个决定，那就是，以来访者制造的屏障将所有国家的城市全部笼罩，将异生兽全部排斥在外，使其不能进入城市吸收到恐惧，他们就无法进化。
而且还在每个国家都建立了能够容纳恐惧分子的忘川之海，同时，使用来访者的忘川消除了整个世界所有人关于异生兽的记忆，使其重新回到了原本的生活。
而且为了掩盖新宿事件真正的事实，国家对外谎称是宇宙来的一颗陨石造成的。
只有那些各国的首脑才知道这些异生兽的资料。
为了进一步消灭这些异生兽，最终一个计划摆在了各国会谈的桌面上，那就是：“N计划！”
随着计划的实施，各国也在研究着异生兽的细胞和抗体，终于位于太阳国关东地区所建立的忘川之海由于长时间能量爆满，从而泄露了。
泄露了的异生兽恐惧因子导致新宿周围的地区的空间异生兽再次疯狂进化，已经到了不能阻挡的趋势了。
最终，北米和太阳国商议，在太阳国关东支部的忘川之海的地方建立了N计划的附属计划，也多出来一个部门——TLT—J！
随着TLT—J的负责人松永要一郎和部下夜袭队的战斗下，这些进化了的异生兽重新死亡化成分子。
TLT的夜袭分为三个小队，A，B，C三个小队，B